UCSC和Ensembl的异同
总结：如何选择？ 选 UCSC：若需要直观的基因组可视化、整合多源数据展示，或使用历史版本数据（如 hg19）。 选 Ensembl：若需要系统的基因注释、变异功能分析，或通过编程接口批量处理数据。 实际研究中，两者常结合使用：例如用 UCSC 可视化基因组结构，用 Ensembl 的 VEP 分析变异影响，或通过 BioMart 获取跨物种注释数据。 一、相同点 核心目标均致力于存储、整
RefSeq与其注释
如下图所示（第二张图是第一张的内容展开）： 一、核心区别：概念的侧重点不同 维度 RefSeqs of Annotated Genomes RefSeqs maintained independently of Annotated Genomes 定义核心 所属关系：RefSeq 序列是 “注释基因组” 的组成部分，即经过注释的基因组中所使用的参考序列。 维护逻辑：RefSeq
vim教程
一、先掌握「三大模式」：Vim 的灵魂！1.命令模式（默认启动进入） 作用：像「指挥官」，输入命令控制 Vim（不能直接打字）。 怎么进入：打开 Vim 就自动在这模式，按ESC键也会回到这模式（新手记不住就多按几次 ESC）。 2.插入模式（打字模式） 作用：像「打字机」，可以输入文字。 怎么进入：在命令模式按以下键： i：在当前位置插入（最常用） a：在光标后面追加 o：在当前行下方新开一行
四种 BLAST 工具
内容源自豆包AI 四种 BLAST 工具对比表格 工具名称 核心功能 工作方式 适用场景 举例 PSI-BLAST 找远亲蛋白质序列 1. 先做一次普通 BLAST，找出一批相似序列； 2. 把这些序列的共性整理成 “特征档案”（Profile）； 3. 用 “特征档案” 再次搜索数据库，找到更多相似但更远缘的序列； 4. 重复步骤 2-3，直到找不到新序列为止。 发现新蛋白家族或研
如何运行plink软件
软件配置首先是下载软件：https://www.cog-genomics.org/plink/1.9/ 下载到本地，解压即可。 比如windows系统，解压下如下： 第一种方法：直接调用很多人都是先在windows键找到cmd，然后再进入相关文件夹，其实有个简单的方法：直接在文件夹路径中输入cmd回车： 上面黑黑的框，就是cmd的终端，在里面运行plink软件。 如果输入plink.exe
生信数据格式
生物信息学中常用的数据格式主要用于存储、处理和传输基因组、蛋白质等生物分子数据，以下是对它们的通俗描述： 一、核酸序列相关格式1.FASTA 格式 用途：存储核酸（DNA/RNA）或蛋白质的序列信息。 特点： 以>开头作为序列标识（后面跟名称和注释），例如：>human_gene1 接下来的每行是序列字符（A、T、C、G 等），可换行但无其他符号。 例子： plaint
应用层
第六章 应用层1. 网络应用模型1.1 客户/服务模型 服务器：提供计算服务的设备 永久提供服务 永久性访问地址/域名 客户机：请求计算机服务的主机 与服务器通信，使用服务器提供的服务 间歇性接入网络 可能使用动态IP地址 不与其他客户机直接通信 应用：Web，文件传输FTP，远程登录，电子邮件 1.2 P2P模型 不存在永远在线的服务器 任意端系
传输层
第五章 传输层1. 传输层概述1.1 功能 传输层提供进程和进程之间的逻辑通信。 复用和分用 传输层对收到的报文进行差错检测。 传输层的两种协议。 1.2 复用和分用 传输层的复用和分用 复用：发送方不同的应用进程都可使用同一个传输层协议传送数据 分用：接收方的传输层在剥去首部后把数据交付给相应的协议 网络层的复用和分用 复用：发送方不同的数据都可以封装成IP数据报发送出去