一、核心功能对比表 维度 –assoc –logistic 统计方法 卡方检验 / Fisher 精确检验 逻辑回归（Logistic Regression） 适用场景 简单病例对照（无协变量） 需校正协变量（年龄、性别等） 协变量支持 ❌ 不支持 ✅ 支持（–covar参数） 基因 - 环境交互 ❌ 不支持 ✅ 支持（–interaction参数） 输出结果

1. 对比 参数 –logistic –adjust 用途 运行逻辑回归模型，分析 SNP 与二分类性状的关联（排除环境等技术因素） 校正多重检验导致的假阳性问题 统计方法 逻辑回归（Logistic Regression） 多重检验校正（如 Bonferroni、FDR） 解决的问题 处理混杂因素、基因 - 环境交互等复杂关系 控制全基因组范围内的假阳性率 输出结果 回归系

一、遍历字典的key 借助keys()函数的调用 代码体验： 123dict1 = {'name': 'Rose', 'age': 30, 'sex': '女'}for key in dict1.keys(): print(key) 返回结果：

本文主要介绍在Linux环境下blast+的安装以及使用 1. 安装 进入这个网址https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 选择合适的Linux版本，然后复制链接 在Linux中拉取安装包 1wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast

源自豆包AI BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是生物学领域超实用的 “序列比对神器”，能快速找出核酸或蛋白质序列之间的相似性。 一、BLAST 的核心作用：像 “文字查重” 一样比对序列假设你有一段基因序列（比如 ATCGGTAC…），想知道它和已知的基因有啥关系： BLAST 就像拿这段序列去 “图书馆” 查资料：这个 “图书馆” 里存着全世

EST（Expressed Sequence Tag，表达序列标签）是基因研究中一个很实用的概念，下面用通俗的方式来解释它： EST 是什么？—— 基因的 “快递单号”如果把人体所有基因比作一个巨大的 “图书馆”，每个基因就是一本书。EST 就像这本书的 “快递单号” 或 “简短摘要”—— 它是从基因转录成的mRNA（信使 RNA） 上提取的一小段序列（通常长度为 200-500 个碱基）。

维度 MAF 质控 多重检验校正（必须步骤） 目标 过滤低频变异，提升数据质量（非变异或偶然变异不能作为参考目标的基因） 控制全基因组检验的假阳性率（排除不是目标性状的基因） 处理对象 变异（SNP）本身的频率特征 关联分析后的 p 值分布 阶段 关联分析前的预处理 关联分析后的结果处理 方法示例 设置 MAF>0.01 阈值排除低频变异 Bonferroni（p×N

编号样例：NM_025011， NR_130915.1， NR_130915 “NM_”, “XM_” ： 编号的首字母常为 N 或者 X ，N 表示该数据是通过实验验证的，X 表示的是该数据是未经实验证实，通过生物信息学方法计算预测出的。 “NR_”, “NP_”, “NM_”：编号的第二各字母常为 R，P，M 表示该数据的类型。含义见下表 第二个字母 分子类型 含义 C G

本次我们将以NCBI的GenBank为例，分别通过浏览一个原核基因和一个真核基因，教给大家如何解读一级核酸数据库。 网站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 1 原核细胞基因我们首先浏览编码大肠杆菌（原核生物）dUTPase的基因。他在GenBank里的数据库编号是X01714。 1、从NCBI的主页选择GenBank数据库，这个Nucleotid

本文以Hexo生成静态网页，部署到OSS中 1. 创建Bucket 在创建Bucket页面中主要有下面几个选项： Bucket名称：创建一个唯一的名称 地域：可以选择默认的 存储冗余类型：标准存储 存储冗余类型：选本地冗余存储，因为便宜 注意这里的阻止公共访问和读写权限我们在创建的时候无法更改，只能在创建之后更改 更改访问权限 在对象存储OSS页面的右侧，点击Bucket列表，选中你